Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms