Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snw1Q9CSN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snw1Q9CSN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.5 ms