Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms