Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms