Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms