Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms