Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms