Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms