Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms