Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms