Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQ90 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms