Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpa3Q9CQ71 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms