Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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