Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med21Q9CQ39 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med21Q9CQ39 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med21Q9CQ39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med21Q9CQ39 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms