Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms