Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg3Q9CPX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms