Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl17Q9CPR4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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