Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim12aQ99PQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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