Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms