Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms