Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms