Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rims1Q99NE5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms