Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms