Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brms1Q99N20 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms