Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac9Q99N13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms