Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6cQ99N08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms