Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dnaja3Q99M87 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dnaja3Q99M87 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dnaja3Q99M87 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms