Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms