Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms