Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms