Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms