Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms