Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps4Q99KG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms