Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Me2Q99KE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms