Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmagpQ99KC7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmagpQ99KC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms