Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdxdc1Q99K01 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdxdc1Q99K01 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms