Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdcbp2Q99JZ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sdcbp2Q99JZ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms