Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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TrabdQ99JY4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TrabdQ99JY4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TrabdQ99JY4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TrabdQ99JY4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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