Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EpcamQ99JW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms