Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GatbQ99JT1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms