Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg5Q99J83 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms