Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ddb2Q99J79 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddb2Q99J79 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddb2Q99J79 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddb2Q99J79 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ddb2Q99J79 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ddb2Q99J79 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddb2Q99J79 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ddb2Q99J79 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ddb2Q99J79 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ddb2Q99J79 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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