Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfdQ925I7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms