Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim7Q923T7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms