Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b3Q921M3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms