Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab4bQ91ZR1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab4bQ91ZR1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms