Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpe65Q91ZQ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpe65Q91ZQ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms