Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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