Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms