Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm2Q91YD4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm2Q91YD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm2Q91YD4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms